每一根色譜柱都有一個大致的進樣針數(shù)壽命，理論上可以有一個規(guī)定，達到進樣多少針，就強制報廢。
不過好像并沒有這樣的規(guī)定，那么也可以作為一個參考，當色譜柱的柱性能參數(shù)（就是常說的理論塔板數(shù)、分離度、拖尾因子等等）不達標時，參照進樣針數(shù)判斷是柱子壽命到了，屬于不可逆因素，只能換柱子。
還是其它原因，如流動相配制錯誤，或者流動相變質(zhì)了，也可能稀釋液強度太大，也可能是方法就是錯的，也可能是樣品本身問題。

不過色譜柱的累積性損壞自然不是一朝一夕的事，柱性能是緩慢下降的，但是沒有一個特定的標準，要看具體的分析方法，而且跟柱型號也有關(guān)系。
常規(guī)的分析方法下C18柱壽命是很長的，因為C18柱是目前技術(shù)最先進，質(zhì)量最可靠，使用最廣泛的色譜柱，在常規(guī)分析方法下，基本上不會損壞。
但是如果流動相比較特殊，如高鹽、高pH>8、低pH<1、高柱溫、高比例水相、高比例有機相等等，色譜柱的損壞就會相應(yīng)地加劇。

這些可以算作是化學(xué)損傷，如果是操作不當，例如，流動相和樣品溶液沒有過濾，或者撞擊色譜柱等，也會造成物理損傷，也會嚴重影響色譜柱壽命，甚至是“一招斃命”。
前面提到了柱型號，不同型號的色譜柱壽命當然也不一樣，跟前面說到的C18類似的，CN柱、苯基柱等鍵合硅膠柱都具有較長的使用壽命。
不過所有基于硅膠基質(zhì)的色譜柱都有一個天生的弱點，就是硅膠是能被水溶解的，雖然溶解度很小，但是長年累月使用，尤其在反相色譜系統(tǒng)中，累加了高鹽、高pH、高柱溫、高比例水相等方法參數(shù)后，硅膠的流失尤為明顯。

不過，是有一種方法可以解決這個問題的，就是在色譜柱前加一個柱芯與色譜柱類型相同的預(yù)柱，也叫保護柱，當流動相里溶解預(yù)柱里的硅膠飽和以后，就不再侵蝕色譜柱的硅膠，從而大大延長色譜柱壽命。不過不到萬不得已還是不要使用特別苛刻的流動相，要知道預(yù)柱的柱芯也是很貴的，那就是一根較短的色譜柱啊，就算保住了色譜柱，經(jīng)常換柱芯也是吃不消的。
但是，有一些類型的色譜柱，天生就是短命鬼，例如NH2柱，有時候好不容易平衡好系統(tǒng)，進個幾十針樣就OVER了，像是一次性的。就像焰火，它華麗的現(xiàn)身，轉(zhuǎn)瞬就湮滅了。
這些就留待色譜柱專家們?nèi)ラ_發(fā)更加穩(wěn)定可靠的新填料了。

還有一類柱子，就是手性分離柱，這在醫(yī)藥行業(yè)是很大的一個應(yīng)用。
通常手性色譜柱是正相柱，這就要求我們在使用手性柱之前要先把系統(tǒng)置換干凈，再接上柱子用流動相沖洗平衡進樣。
通常是甲醇、異丙醇、正已烷+異丙醇、流動相這樣的順序，如果忘記這個過程，會造成很大的麻煩。

而且有一些手性柱是涂敷柱，例如淀粉、纖維素等大分子涂敷柱非常怕水，如果系統(tǒng)中原來的反相流動相沒有置換干凈，就會對色譜柱造成不可逆損傷，甚至報廢。
近年來，科學(xué)家也開發(fā)出了鍵合的手性柱，相比較要穩(wěn)定的多，甚至也可以應(yīng)用反相色譜系統(tǒng)。
使用后對色譜柱的沖洗保存也比較重要，使用了緩沖系統(tǒng)的尤其要注意。

這里推薦一個反相色譜系統(tǒng)的通用沖洗流程：將所有通道置換成含有較低有機相比例的水相中，比如10-30%乙腈或甲醇，然后沖洗1個小時，然后再梯度增加有機相比例，各沖洗一定時間，最終保留在高有機相比例的沖洗液里。
低有機相比例的沖洗液是為了盡可能地沖洗緩沖鹽。
通常低壓梯度洗脫的液相色譜儀采用的是四元泵，就是單泵四通道，比例閥混合。

這種混合方式有個弊端，就是混合效果差，因為各通道不同比例是通過開關(guān)各通道閥的時間來控制的。
打比方乙腈：緩沖鹽=50：50，如果流速是1.0mL/min，并不是說乙腈和緩沖鹽以各0.5mL/min的流速來混合；而是流速一直是1.0mL/min，但是在往復(fù)泵一個來回的時間內(nèi)，兩個通道分別打開一半的時間，也就是說系統(tǒng)管道里是一段乙腈、一段緩沖鹽。
這樣就會造成鹽的析出。所以，往往是兩通道混合，就算沒有用緩沖鹽，還是建議先按比例混合好了，然后走單通道，否則的話一樣會造成鹽析出，或者基線波動。走梯度洗脫的話，往往會把有機相通道（B）中加入一定比例的水，或者把水相通道（A）配成梯度洗脫的初始比例，把有機相通道（B）配成梯度洗脫最終的比例。

這里有兩點需要說明：
第一：一般認為，色譜系統(tǒng)包括色譜柱的沖洗甚至保存，都可以使用流動相，只是不加緩沖鹽、酸堿等。例如上面提到的乙腈：緩沖鹽=50：50，做完樣品以后，就可以用50%乙腈/水來沖洗保存。
有一些品牌色譜柱，建議如果不是含鹽或者強酸強堿，一般不建議沖洗。
不過這只適合短期保存，也就是沒隔多久又要再次使用。

長期不用的色譜系統(tǒng)包括色譜柱還是應(yīng)該沖洗后保存在高比例低極性溶劑體系中。
一般建議正相系統(tǒng)保存在正已烷：異丙醇=90：10，反相系統(tǒng)保存在乙腈：水=90：10或者100%乙腈中。

第二：隨著快速分離色譜柱的發(fā)展，很多的低粒徑色譜柱得到應(yīng)用，而且往往柱溫也較高，通常達到50度或以上，這種色譜系統(tǒng)通常柱壓也較高，貿(mào)然用高比例水相沖洗可能會導(dǎo)致系統(tǒng)超壓。
可以先用流動相沖洗，或者斷開色譜柱，用高比例水相沖洗系統(tǒng)，再接上柱子逐步提高有機相比例沖洗，也可以先調(diào)低流速沖洗。
而且，最好待沖洗快要結(jié)束時再降低柱溫。

下面說說氣相色譜柱，現(xiàn)如今填充柱幾乎退出了歷史，人們說起氣相色譜柱自然就是石英毛細管柱。
相比較液相色譜柱，感覺氣相柱要簡單的多，而且，往往氣相柱各型號之間的專屬也不那么強，往往一個樣品用多種色譜柱分析，通過調(diào)整溫度程序，也可以得到相類似的分析結(jié)果。結(jié)合到本文標題，氣相色譜柱的進樣針數(shù)同樣也僅供參考，不能作為色譜柱壽命的唯一參數(shù)，影響氣相色譜柱的壽命的因素基本為高溫、高溫時間、樣品中的高沸物（包括一些在不適合的方法中，樣品的分解或聚合物）、載氣純度等。

常規(guī)的氣相色譜柱通常是石英管表面涂敷的液體填料，所以一般情況下，氣相色譜的分離其實是氣化后的樣品在液體填料里的溶解再揮發(fā)的性質(zhì)不同來實現(xiàn)的。那么既然填料是液體，自然就會揮發(fā)了，氣相色譜柱的壽命最大的影響因素就在這里。氣相色譜柱都會有一個極限溫度，一般使用溫度會在這個極限溫度下的20度左右。通常氣相分析方法是程序升溫的，高溫的溫度和保留時間決定了每一次進樣對色譜柱的影響。不過不同類型的色譜柱因為其填料的性質(zhì)不同，其極限溫度也不同，自然最高使用溫度就不同。反過來說，在相同使用溫度下，其壽命也不相同。

不管什么分析方法都要盡可能的真實反應(yīng)樣品里的溶劑及所有物質(zhì)的含量， 氣相色譜分析樣品的首要條件是，樣品要能被氣化，就是進樣口溫度及程序終溫要大于樣品的沸點（這也不是絕對的），當樣品中有高沸點的物質(zhì)，甚至是無機鹽、機械雜質(zhì)，不能被氣化留在了襯管里，甚至留在了色譜柱中，就會對色譜柱有損傷。這種情況最好是要處理一下樣品，萃取、蒸餾、過濾都是常用的方法。如果實在無法避免，就要經(jīng)常更換隔墊、襯管玻璃毛等，過一定時間還要把色譜柱前段割一段下來，通常是1米左右。除了這些，還應(yīng)注意對樣品性質(zhì)的了解，如果樣品的熱穩(wěn)定性差，進樣分析過程中發(fā)生了分解或者聚合，產(chǎn)生高沸物就會對色譜柱產(chǎn)生很大影響，如果這些物質(zhì)不能被溶劑沖洗的話，這種損傷就是不可逆的，而且分析結(jié)果也不準確。這種情況下就要適當?shù)慕档蜏囟龋钡讲话l(fā)生這種反應(yīng)。或者換其它的分析方法。

通常我們使用的載氣是高純氮氣，原因就兩個字——便宜！但是，排除經(jīng)濟因素，這并不是一個最佳的選擇。因為氮氣的生產(chǎn)就是液態(tài)空氣蒸發(fā)來的，但是因為氮氣和氧氣性質(zhì)接近，一般很難杜絕高純氮氣里含有少量的氧氣。氧氣在高溫柱對整個氣相色譜系統(tǒng)包括色譜柱都會產(chǎn)生不良影響。所以一般儀器廠家還是建議使用高純氦，尤其在進行計量、驗證等高標準分析時，不過一瓶高純氦可以換5瓶高純氮，一般用戶還是選擇使用高純氮氣。其實從儀器性能來講，也可以使用高純氫氣作為載氣，低含氧量、低背景、低廉的價格都是不錯的選擇，當然一般考慮到氫氣的泄漏以及儲運的風險，往往被用戶所排除。不過，帶TCD檢測器的氣相色譜往往還是使用高純氫氣作為載氣。